生物导体版本:版本(3.13)
Hopach聚类算法通过递归对数据集进行递归分区,同时订购并可能在每个级别折叠簇来构建簇的层次树。该算法使用平均/中位分式轮廓(MSS)标准来识别具有最大均匀簇的树的水平。它还将树运行以产生元素的最终排序列表。非参数引导程序允许人们估计每个元素属于每个群集的概率(模糊集群)。
作者:Katherine S. Pollard,与Mark J. van der Laan
维护者:Katherine S. Pollard
引用(从r内,输入引用(“ Hopach”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.1”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ hopach”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
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Browsevignettes(“ Hopach”)
R脚本 | 霍巴赫 | |
参考手册 |
生物浏览 | 2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 |
版本 | 2.52.0 |
在生物导体中 | Bioc 1.6(R-2.1)或更早(> 16年) |
执照 | GPL(> = 2) |
要看 | r(> = 2.11.0),簇,,,,生物酶, 方法 |
进口 | 图形,grdevices,统计,utils,生物基因 |
链接 | |
建议 | |
系统要求 | |
增强 | |
URL | http://www.stat.berkeley.edu/~laan/http://docpollard.org/ |
取决于我 | |
进口我 | 表,,,,ScClassify,,,,Treekor |
建议我 | 生物探测 |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | hopach_2.52.0.tar.gz |
Windows二进制 | hopach_2.52.0.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | hopach_2.52.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/hopach |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:套餐/hopach |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/hopach/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |
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