霍巴赫

doi:10.18129/b9.bioc.hopach

分层有序分区和崩溃的混合动力车(Hopach)

生物导体版本:版本(3.13)

Hopach聚类算法通过递归对数据集进行递归分区,同时订购并可能在每个级别折叠簇来构建簇的层次树。该算法使用平均/中位分式轮廓(MSS)标准来识别具有最大均匀簇的树的水平。它还将树运行以产生元素的最终排序列表。非参数引导程序允许人们估计每个元素属于每个群集的概率(模糊集群)。

作者:Katherine S. Pollard,与Mark J. van der Laan 和Greg Wall

维护者:Katherine S. Pollard

引用(从r内,输入引用(“ Hopach”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.1”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ hopach”)

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文档

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Browsevignettes(“ Hopach”)

PDF R脚本 霍巴赫
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细节

生物浏览 2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯
版本 2.52.0
在生物导体中 Bioc 1.6(R-2.1)或更早(> 16年)
执照 GPL(> = 2)
要看 r(> = 2.11.0),,,,,生物酶, 方法
进口 图形,grdevices,统计,utils,生物基因
链接
建议
系统要求
增强
URL http://www.stat.berkeley.edu/~laan/http://docpollard.org/
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进口我 ,,,,ScClassify,,,,Treekor
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源包 hopach_2.52.0.tar.gz
Windows二进制 hopach_2.52.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) hopach_2.52.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/hopach
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:套餐/hopach
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/hopach/
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