iSEE

DOI:10.18129 / B9.bioc.iSEE

交互式总结实验浏览器

Bioconductor版本:发行版(3.13)

创建一个交互式的基于shine的图形用户界面，用于探索存储在summarizeexperiment对象中的数据，包括行和列级元数据。该接口支持在图和表之间传输选择、代码跟踪、交互式浏览、交互式或程序化初始化、保存应用程序状态以及通过S4类扩展到新面板类型。对singlecellexperexperiment对象中的单单元数据给予了特别的关注，并提供了降维结果的可视化。

作者:Kevin Rue-Albrecht，费德里科·马里尼[法国]，夏洛特·索尼森[au]，亚伦·伦[au]

维护人员:Kevin Rue-Albrecht

安装

要安装此包，启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("iSEE")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes (iSEE)

超文本标记语言	R脚本	1.iSEE用户指南
超文本标记语言	R脚本	2.跨面板共享信息
超文本标记语言	R脚本	3.配置iSEE应用程序
超文本标记语言	R脚本	4.ExperimentColorMap类
超文本标记语言	R脚本	5.部署自定义面板
超文本标记语言	R脚本	6.利用iSEE和大数据
超文本标记语言	R脚本	7.语音识别
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯
版本	测试盒框
在Bioconductor公司	BioC 3.7 (R-3.5)(3年)
许可证	MIT +文件许可证
取决于	SummarizedExperiment，SingleCellExperiment
进口	方法,BiocGenerics，S4Vectors， utils, stats，闪亮的，shinydashboard，shinyAce，shinyjs，DT，rintrojs，ggplot2，ggrepel，colourpicker，igraph，vipor，mgcv，图形，grDevices，viridisLite，shinyWidgets，ComplexHeatmap，circlize、网格
链接
建议	testthat，BiocStyle，knitr，rmarkdown，scRNAseq，TENxPBMCData，嘘，DelayedArray，HDF5Array，RColorBrewer，冬青，htmltools
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/iSEE/iSEE
BugReports	https://github.com/iSEE/iSEE/issues
全靠我	iSEEu
进口我
建议我	DuoClustering2018，HCAData，schex，TabulaMurisData
给我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	iSEE_2.4.0.tar.gz
Windows二进制	iSEE_2.4.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	iSEE_2.4.0.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/iSEE
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/iSEE
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/iSEE/
软件包下载报告	下载数据