Biocometiond版本:释放(3.12)
即使当这些源相关时,迭代调整的代理变量分析(IA-SVA)是一种统计框架,即使这些源相关。IA-SVA为i提供了一种灵活的方法,识别对所有已知因素的调整时不需要的异质性的隐藏因子;ii)测试推定隐藏因子的意义,以解释数据的未拼模具的变化;和III)如果重要的话,使用估计因子作为下一次迭代中的其他已知因素,以发现进一步的隐藏因子。
作者:Donghyung Lee [Aut,Cre],Anthony Cheng [Aut],Nathan Lawlor [Aut],Duygu Ucar [Aut]
维护者:Donghyung Lee
引文(从R内,输入引文(“IASVA”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“4.0”)并输入:
if(!percenamespace(“biocmanager”,squilly = true))install.packages(“biocmanager”)biocmanager ::安装(“iasva”)
对于旧版本,请参阅相应的生物导体释放。
要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:
BROWSEVIGNETTES(“IASVA”)
HTML. | r script. | 检测单细胞RNA-SEQ数据中的隐藏异质性 |
PDF. | 参考手册 | |
文本 | 新闻 |
Biocviews. | 2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 |
版 | 1.8.0. |
在生物导体中以来 | BIOC 3.8(R-3.5)(2年) |
执照 | GPL-2 |
依靠 | r(> = 3.5) |
进口 | IRLBA.,统计,簇,图形,概括分析那生物相投 |
链接到 | |
建议 | kn那testthat.那RAMAMAMDOW.那SVA.那RTSNE.那Pheatmap.那控制那desctools.那rcolorbrewer. |
系统要求 | |
加强 | |
URL. | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接给我 | |
建立报告 |
跟随安装在r会话中使用此包的说明。
源包 | IASVA_1.8.0.tar.gz. |
Windows二进制文件 | IASVA_1.8.0.zip. |
Macos 10.13(高塞拉) | IASVA_1.8.0.TGZ. |
源存储库 | git clone https://git.biocumon.org/packages/iasva. |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.biocondion.org:包/ IASVA |
包短网址 | https://biocumon.org/packages/iasva// |
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