- 家
- Biocumon 3.12.
- 软件包
- 理想
理想
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DOI：10.18129 / b9.bioc.ideal.
交互式差异表达分析
Biocometiond版本：释放（3.12）
该包提供了用于RNA测序数据集的交互式差异表达分析的功能，在差异表达的步骤下游提取和有效地提取信息。闪亮的应用程序封装了整个包装。
作者：Federico Marini [Aut，Cre]
维护者：Federico Marini
引文（从R内，输入引文（“理想”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.0”）并输入：
if（！quanceNamespace（“biocmanager”，静静= true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“理想”）
对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。
文件
要查看系统中安装此包版本的文档，请启动r并输入：
BROWSEVIGNETTES（“理想”）
| HTML. | r script. | 理想用户指南 |
| PDF. | 参考手册 | |
| 文本 | 新闻 | |
| 文本 | 执照 |
细节
| Biocviews. | 2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 |
| 版 | 1.14.0 |
| 在生物导体中以来 | BIOC 3.5（R-3.4）（3.5岁） |
| 执照 | mit +文件执照 |
| 依靠 | 顶点 |
| 进口 | deseq2.那概括分析那Genomicranges.那绞喉那S4Vectors.那ggplot2.（> = 2.0.0），热克服那情节那Pheatmap.那pcaexplorer.那IHW.那贡献那沮丧那Goseq.那stringr.那dplyr.那林马那古司裤那go.db.那annotationdbi.那闪亮（> = 0.12.0），Shinydashboard那Shinybs.那DT.那伦敦那rintrojs.那GGRepel.那kn那RAMAMAMDOW.那闪亮空间那生物相投，grdevices，Base64cn.， 方法 |
| 链接到 | |
| 建议 | testthat.那生物焦那呼吸道那org.hs.eg.db.那txdb.hsapiens.ucsc.hg38.knowngene.那畸形那edger. |
| 系统要求 | |
| 加强 | |
| URL. | https://github.com/federicomarini/ideal.https://federicomarini.github.io/ideal/ |
| Bugreports. | https://github.com/federicomarini/ideal/issues. |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接给我 | |
| 建立报告 |
包档案包
跟随安装在r会话中使用此包的说明。
| 源包 | Ideal_1.14.0.tar.gz. |
| Windows二进制文件 | Ideal_1.14.0.zip. |
| Macos 10.13（高塞拉） | Ideal_1.14.0.tgz. |
| 源存储库 | git clone https://git.biocumon.org/packages/ideal. |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.biocondion.org：包装/理想 |
| 包短网址 | https://biocumon.org/packages/ideal/ |
| 包裹下载报告 | 下载统计信息 |
