等压线

DOI:10.18129 / B9.bioc.isobar

等压标记的MSMS蛋白质组学数据的分析和定量

Bioconductor版本:发行版(3.13)

isoobar为定量质谱蛋白质组学数据的分析提供了预处理、归一化和报告生成的方法，如iTRAQ和TMT等压标记。集成和验证以ptm为中心的数据集(isobar-PTM)的特性模块。更多信息请访问http://www.ms-isobar.org。

作者:Florian P Breitwieser < Florian。bw gmail.com >而且Jacques Colinge , with contributions from Alexey Stukalov , Xavier Robin and Florent Gluck

维护者:Florian P Breitwieser < Florian。bw gmail.com >

安装

要安装此包，启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“等压线”)

PDF	R脚本	等压线为开发人员2021欧洲杯体育投注开户
PDF	R脚本	用于PTM数据集量化的等压线
PDF	R脚本	iTRAQ和TMT蛋白定量的等压包
PDF	R脚本	等压线包的用例
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯
版本	1.38.0
Bioconductor自	BioC 2.9 (R-2.14)(9.5年)
许可证	LGPL-2
取决于	R (> = 2.10.0),Biobase、统计数据、方法
进口	分配，plyr，biomaRt，ggplot2
链接
建议	MSnbase，OrgMassSpecR，XML，RJSONIO，Hmisc，gplots，RColorBrewer，gridExtra，limma，引导，DBI，质量
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/fbreitwieser/isobar
BugReports	https://github.com/fbreitwieser/isobar/issues
取决于我
进口我
建议我	RforProteomics
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	isobar_1.38.0.tar.gz
Windows二进制	isobar_1.38.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13 (High Sierra)	isobar_1.38.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/isobar
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/等压线
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/isobar/
包下载报告	下载数据