Lefser

doi：10.18129/b9.bioc.lefser

r实施微生物组生物标志物发现的Lefse方法

生物导体版本：版本（3.15）

Lefser是微生物组生物标志物发现的流行“ LDA效应大小（LEFSE）”方法的R。它使用Kruskal-Wallis检验，Wilcoxon量级总和和线性判别分析来找到组和子组的生物标志物。

作者：Asya Khleborodova [CRE，AUT]，路德维希·盖斯林格[CTB]，Marcel Ramos [CTB]，Levi Waldron [CTB]

维护者：asya khleborodova

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ lefser”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“ lefser”）

html	R脚本	在微生物组分析中，流行的Lefse生物标志物发现的Lefser R实施简介。
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯
版本	1.6.0
在生物导体中	Bioc 3.12（R-4.0）（1。5年）
执照	艺术2.0
要看	总结性特征，R（> = 4.0.0）
进口	硬币，，，，大量的，，，，GGPLOT2，统计，方法
链接
建议	尼特，，，，rmarkDown，，，，策划的元素元素，，，，生物使用，，，，测试，，，，pkgdown，，，，COVR，，，，用
系统要求
增强
URL	https://github.com/waldronlab/lefser
BugReports	https://github.com/waldronlab/lefser/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	lefser_1.6.0.tar.gz
Windows二进制	lefser_1.6.0.zip（仅64位）
MacOS 10.13（高山脉）	lefser_1.6.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/lefser
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/lefser
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/lefser/
软件包下载报告	下载统计