Lisaclust

doi:10.18129/b9.bioc.lisaclust

Lisaclust:空间关联局部指标的聚类

生物导体版本:版本(3.15)

Lisaclust提供了一系列功能来识别和可视化组织区域的区域,而细胞类型之间的空间关联相似。该软件包可用于在多重成像数据中提供细胞类型共定位的高级摘要,该数据已通过单细胞分辨率进行了分割。

作者:Ellis Patrick [Aut,Cre],Nicolas Canete [aut]

维护者:埃利斯·帕特里克(Ellis Patrick)

引用(从r内,输入引用(“ Lisaclust”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ Lisaclust”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Lisaclust”)

html R脚本 对Lisaclust的脱落
PDF 参考手册

细节

生物浏览 2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯
版本 1.4.0
在生物导体中 Bioc 3.13(R-4.1)(1年)
执照 GPL(> = 2)
要看 R(> = 4.1)
进口 GGPLOT2,,,,班级,,,,凹者, 网格,生物比较,,,,spatstat.core,,,,spatstat.geom,,,,生物基因,,,,S4VECTORS, 方法,spicyr,,,,purrr,统计Data.Table,,,,dplyr,,,,花花公子
链接
建议 生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown
系统要求
增强
URL
BugReports https://github.com/ellispatrick/lisaclust/issues
取决于我
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构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 lisaclust_1.4.0.tar.gz
Windows二进制 lisaclust_1.4.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) lisaclust_1.4.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/lisaclust
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/lisaclust
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/lisaclust/
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