马提尼

doi：10.18129/b9.bioc.martini

GWAS合并网络

生物导体版本：版本（3.15）

马提尼人通过使用表示为网络的先验知识来处理GWAS研究固有的低功率。SNP是网络的顶点，边缘代表它们之间的生物学关系（基因组邻接，属于相同基因，蛋白质产物之间的物理相互作用）。使用SCONE扫描网络，该网络寻找与表型最大相关的SNP组，这些SNP形成了近距离的子网。

作者：Hector Climente-Gonzalez [AUT，CRE]，Chloe-Agathe Azencott [aut]

维护者：hector climente-gonzalez

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ Martini”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ Martini”）

html	R脚本	跑步烤饼
html	R脚本	模拟基于烤饼的表型
PDF		参考手册

细节

生物浏览	2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯
版本	1.16.0
在生物导体中	Bioc 3.7（R-3.5）（4年）
执照	GPL-3
要看	R（> = 4.0）
进口	Igraph（> = 1.0.1），矩阵，方法（> = 3.3.2），RCPP（> = 0.12.8），snpstats（> = 1.20.0），统计，utils
链接	RCPP，，，，rcppeigen（> = 0.3.3.5.0）
建议	Biomart（> = 2.34.1），循环（> = 0.4.11），StringDB（> = 2.2.0），httr（> = 1.2.1），iranges（> = 2.8.2），S4VECTORS（> = 0.12.2），备忘录（> = 2.0.0），尼特，，，，测试，，，，readr，，，，rmarkDown
系统要求
增强
URL	https://github.com/hclimente/martini
BugReports	https://github.com/hclimente/martini/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	Martini_1.16.0.tar.gz
Windows二进制	Martini_1.16.0.zip（仅64位）
MacOS 10.13（高山脉）	Martini_1.16.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/martini
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：包装/马提尼酒
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/martini/
软件包下载报告	下载统计