METASEQR2.

DOI:10.18129 / b9.bioc.metaseqr2.

通过组合多种统计算法来分析和结果报告RNA-SEQ数据的RNA

Biocometiond版本:释放(3.12)

为RNA-SEQ基因表达数据提供若干标准化和统计测试包的界面。此外,它通过组合多个统计测试的结果来创建多个诊断图,执行元分析,并以交互方式向结果报告结果。

作者:Panagiotis Moulos [Aut,CRE]

维护者:Panagiotis Moulos

引文(从R内,输入引文(“METASEQR2”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.0”)并输入:

if(!percennamespace(“biocmanager”,squilly = true))install.packages(“biocmanager”)biocmanager ::安装(“metaseqr2”)

对于旧版本,请参阅相应的生物导体释放

文件

要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:

BROWSEVIGNETTES(“MEDASEQR2”)

HTML. r script. 构建METASEQR2的注释数据库
HTML. r script. 使用METASEQR2的RNA-SEQ数据分析
PDF. 参考手册
文本 消息

细节

Biocviews. 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯
版本 1.2.0
在生物导体中以来 BIOC 3.11(R-4.0)(1年)
执照 GPL(> = 3)
依靠 r(> = 4.0.0),deseq2.林马Locfit.,花键
进口 ABSSEQ.贝凯BioBase.生物根系生物相投生物雕生物仪器控制DSS.DT.edaseq.edger.Genefilter.Genomeinfodb.基因管理基因组法Genomicranges.贡献,图形,grdevices,almonicmeanp.热克服htmltools.httr.绞喉雅思石格子log4r.Magrittr.大量的矩阵, 方法,nbpseq.p, 平行,qvalue.RAMAMAMDOW.rmdformats.RSAMTOOLS.rsqlite.rtracklayer.S4Vectors.,统计,stringr.概括分析SURVCOMP.,实用,venndiagram.VSN.yaml.动物园
链接到
建议 Biocmanager.bsgenome.knRMYSQL.运行
系统要求
加强 TCC.
URL. http://www.fleming.gr.
Bugreports. https://github.com/pmoulos/metaseqr2/issues.
取决于我
进口我
建议我
链接给我
建立报告

包档案包

跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。

源包 metaseqr2_1.2.0.tar.gz.
Windows二进制文件 metaseqr2_1.2.0.zip.
Macos 10.13(高塞拉) METASEQR2_1.2.0.TGZ.
源存储库 git clone https://git.biocumon.org/packages/metaseqr2.
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.biocondion.org:包/ MEDASEQR2
包短网址 https://biocumon.org/packages/metaseqr2/
包裹下载报告 下载统计信息

文件»

生物体

R./cr包裹和文件

支持»

请阅读张贴指南。将关于Biocometiond的问题发布到以下位置之一:

  • 支持网站- 关于生物导体包的问题
  • Bioc-devel.邮件列表 - 适用于包开发人员2021欧洲杯体育投注开户