metavizr

doi：10.18129/b9.bioc.metavizr

M Metaviz Web应用程序的R接口进行交互式宏基因组学数据分析和可视化

生物导体版本：版本（3.13）

该软件包为Metaviz Web应用程序（http://metaviz.cbcb.umd.edu）提供了WebSocket通信，以进行元基因组学数据的交互式可视化。R/Bioc交互式会话中的对象可以在图中显示，可以使用acketzoom可视化探索数据。支持基本的生物导体数据结构（例如，mrexperiment对象），同时提供了一种简单的机制来支持其他数据结构。可视化（使用d3.js）也可以轻松地添加到Web应用程序中。

作者：Hector Corrada Bravo [CRE，AUT]，Florin Chelaru [AUT]，Justin Wagner [AUT]，Jayaram Kancherla [aut]，Joseph Paulson [aut]

维护者：hector Corrada bravo

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.1”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ metavizr”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“ metavizr”）

html	R脚本	Metavizr简介
PDF		参考手册
文本		消息
文本		执照

细节

生物浏览	2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯
版本	1.15.0
在生物导体中	Bioc 3.5（R-3.4）（4年）
执照	麻省理工学院 +文件执照
要看	r（> = 3.4），元基因组（> = 1.17.1），方法，Data.Table，，，，生物酶，，，，消化
进口	epivizr，，，，epivizrdata，，，，Epivizrserver，，，，EPIVIZRSTANTALLONE，，，，素食主义者，，，，GenomeInfodB，，，，门索，，，，httr
链接
建议	尼特，，，，生物使用，，，，矩阵，，，，MSD16S（> = 0.109.1），ETEC16S，，，，测试，，，，GSS，，，，策划的元素元素
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	metavizr_1.15.0.tar.gz
Windows二进制	metavizr_1.15.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	metavizr_1.15.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/metavizr
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/metavizr
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/metavizr/
软件包下载报告	下载统计