methylclock

DOI:10.18129 / B9.bioc.methylclock

甲基时钟——DNA甲基化时钟

Bioconductor版本:发行版(3.15)

这个程序包允许使用不同的甲基化时钟来估计年代和妊娠DNA甲基化(DNAm)年龄以及生物年龄。按时间排列的DNAm年龄(以年为单位):Horvath的时钟，Hannum的时钟，BNN, Horvath的皮肤+血液时钟，PedBE时钟和Wu的时钟。妊娠DNAm年龄:奈特时钟，波林时钟，梅恩时钟和李氏时钟。生物学上的DNAm时钟:莱文时钟和端粒长度时钟。

作者:Dolors Pelegri-Siso [aut, cre]，胡安·r·冈萨雷斯[au]

维护者:Dolors Pelegri-Siso < Dolors。在isglobal.org pelegri >

安装

要安装此包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("methylclock")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“methylclock”)

超文本标记语言	R脚本	DNAm年龄使用不同的甲基化时钟
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯
版本	1.2.1 "
Bioconductor自	BioC 3.14 (R-4.1)(1年)
许可证	麻省理工学院+文件许可证
取决于	R (> = 4.1.0),methylclockData，devtools，quadprog
进口	Rcpp(> = 1.0.6),ExperimentHub，dplyr，嫁祸于，PerformanceAnalytics，Biobase，ggpmisc，tidyverse，ggplot2，ggpubr，minfi，宠物猫，RPMM、统计数据、图表、tidyr，gridExtra，preprocessCore，dynamicTreeCut，地球
链接	Rcpp
建议	BiocStyle，knitr，GEOquery，rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/isglobal-brge/methylclock
BugReports	https://github.com/isglobal-brge/methylclock/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	methylclock_1.2.1.tar.gz
Windows二进制	methylclock_1.2.1.zip
macOS二进制(x86_64)	methylclock_1.2.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/methylclock
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ methylclock
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/methylclock/
包下载报告	下载数据
bioc3.15的旧源包	源存档