microbiomedasim

DOI:10.18129 / b9.bioc.microbiomedasim

微生物胺差分丰度仿真

Bioconductor版本:释放(3.13)

用于模拟设计用于纵向分析的差分微生物组数据的工具包。可以为平均趋势指定几种功能形式。从多元正常模型中汲取观察。该方案的目的是能够模拟数据,以便准确地比较不同的纵向方法进行差异丰度。

作者:Justin Williams,Hector Corrada Bravo,Jennifer Tom,Joseph Nathaniel Paulson

维护者:Justin Williams

引文(从R内,输入引文(“microbiomedasim”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.1”)并输入:

if(!percennamespace(“biocmanager”,squiatly = true))install.packages(“biocmanager”)biocmanager ::安装(“microbiomedasim”)

对于旧版本,请参阅相应的生物导体释放

文件

要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:

Browsevignettes(“Microbiomedasim”)

PDF. r script. microbiomedasim
PDF. 参考手册
文本 消息
文本 执照

细节

Biocviews. 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯
版本 1.6.0
在生物导体中以来 BIOC 3.10(R-3.6)(1.5年)
执照 mit +文件执照
依靠 r(> = 3.6.0)
进口 图形,ggplot2.大量的tmvtnorm.矩阵mvtnorm.pbapply.,统计,文学MetagenomeSQ.BioBase.
链接到
建议 testthat.(> = 2.1.0),kndevtools.
系统要求
加强
URL. https://github.com/williazo/microbiomedasim
Bugreports. https://github.com/williazo/microbiomedasim/issues.
取决于我
进口我
建议我
链接给我
建立报告

包档案包

跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。

源包 microbiomedasim_1.6.0.tar.gz.
Windows二进制文件 microbiomedasim_1.6.0.zip.
Macos 10.13(高塞拉) microbiomedasim_1.6.0.tgz.
源存储库 git clone https://git.biocumon.org/packages/microbiomedasim.
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.biocondion.org:包装/ microbiomedasim
包短网址 https://biocumon.org/packages/microbiomedasim/
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