microbiomeexplorer.

DOI：10.18129 / b9.bioc.microbiomeexplorer.

Microbiome探索应用程序

Bioconductor版本：释放（3.13）

MicrobioMeexplorer R包装旨在促进标记基因调查特征数据的分析和可视化。它允许用户通过命令行或包装中包含的交互式闪亮应用程序来执行和可视化典型的微生物组分析工作流程。除了应用常见的分析工作流程，应用程序可以启用自动分析报告生成。

作者：Joseph Paulson [Aut]，Janina Reeder [Aut，Cre]，Mo Huang [Aut]，Genentech [CPH，FND]

维护者：Janina Reeder

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.1”）并输入：

if（！percennamespace（“biocmanager”，squilly = true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“microbiomeexplorer”）

对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。

文件

要查看系统中安装此包版本的文档，请启动r并输入：

BROWSEVIGNETTES（“MicrobioMeeXplorer”）

HTML.	r script.	microbiomeexplorer.
PDF.		参考手册
文本		消息
文本		执照

细节

Biocviews.	2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯
版本	1.2.0
在生物导体中以来	BIOC 3.12（R-4.0）（0.5岁）
执照	mit +文件执照
依靠	闪亮的那Magrittr.那MetagenomeSQ.那BioBase.
进口	Shinyjs.（> = 2.0.0），Shinydashboard那Shinycssloaders.那ShinyWidgets.那RAMAMAMDOW.（> = 1.9.0），deseq2.那rcolorbrewer.那dplyr.那Tidyr.那邮风那rlang.那kn那读书那DT.（> = 0.12.0），BiomFormat， 工具，stringr.那素食主义者那MatrixStats.那热克服那车那扫帚那林马那重塑2.那娇媚那FORCATS.那拉保赛， 方法，情节（> = 4.9.1）
链接到
建议	v8那testthat.（> = 2.1.0）
系统要求
加强
URL.
取决于我
进口我
建议我
链接给我
建立报告

包档案包

跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。

源包	microbiomeexplorer_1.2.0.tar.gz.
Windows二进制文件	microbiomeexplorer_1.2.0.zip.
Macos 10.13（高塞拉）	microbiomeexplorer_1.2.0.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/microbiomeexplorer.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondudard.org：包装/ MicrobioMeeXplorer
包短网址	https://biocumon.org/packages/microbiomeexplorer/
包裹下载报告	下载统计信息