Motifstack

doi:10.18129/b9.bioc.motifstack

单个或多个DNA,RNA和氨基酸序列的情节堆叠徽标

生物导体版本:版本(3.15)

MotifStack软件包设计用于具有不同相似度分数的多个基线的图形表示。它可以与DNA/RNA序列基序和氨基酸序列基序一起使用。此外,它为用户提供了自定义图形参数(例如字体类型和符号颜色)的灵活性。

作者:Jianhong OU,Michael Brodsky,Scot Wolfe和Lihua Julie Zhu

维护者:jianhong ou

引用(从r内,输入引用(“ Motifstack”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ Motifstack”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Motifstack”)

html R脚本 Motifstack Vignette
PDF 参考手册
文本 消息

细节

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版本 1.40.0
在生物导体中 Bioc 2.11(R-2.15)(9。5年)
执照 GPL(> = 2)
要看 R(> = 2.15.1),方法,网格
进口 ADE4,,,,生物弦,,,,GGPLOT2,grdevices,图形,htmlwidgets,Stats,stats4,utils,XML,,,,TFBSTOOLS
链接
建议 格里姆波特,,,,Grimport2,,,,生物基因,,,,主题,,,,rcolorbrewer,,,,生物使用,,,,尼特,,,,运行,,,,rmarkDown,,,,Jaspar2020
系统要求
增强
URL
取决于我 结肠管制
进口我 atacseqqc,,,,ATSNP,,,,达格洛戈,,,,Lowmaca,,,,Motifbreakr,,,,RibosomeProfilingQC,,,,tcgaworkflow
建议我 Chippeakanno,,,,tfutils,,,,Tripr,,,,Universalmotif
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 motifstack_1.40.0.tar.gz
Windows二进制 motifstack_1.40.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) motifstack_1.40.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/motifstack
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:套餐/图案
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/motifstack/
软件包下载报告 下载统计

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  • Bioc-devel邮件列表 - 包装开发人员2021欧洲杯体育投注开户