motifmatchr

DOI:10.18129 / B9.bioc.motifmatchr

R

生物导体版本:发布(3.13)

快速找到母题匹配许多母题和许多序列。包装来自于mood主题调用库的c++代码，该库由Pasi Rastas、Janne Korhonen和Petri Martinmäki开发。

作者:Alicia Schep，斯坦福大学

维护者:Alicia Schep

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!安装BiocManager::install("motifmatchr")

有关较旧版本的R，请参阅适当的Bioconductor释放。

文档

要查看系统中安装的软件包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“motifmatchr”)

超文本标记语言	R脚本	motifmatchr
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯
版本	1.14.0
Bioconductor自	BioC 3.6 (R-3.4)(3.5年)
许可证	GPL-3 +文件许可证
取决于	R (> = 3.3)
进口	矩阵,Rcpp、方法、TFBSTools,Biostrings,BSgenome,S4Vectors,SummarizedExperiment,GenomicRanges,IRanges,Rsamtools,GenomeInfoDb
链接	Rcpp,RcppArmadillo
建议	testthat,knitr,rmarkdown,BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19
SystemRequirements	c++ 11
增强了
URL
取决于我
进口我	enrichTF,esATAC,网页排名
建议我	CAGEWorkflow,chromVAR,MethReg
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	motifmatchr_1.14.0.tar.gz
Windows二进制	motifmatchr_1.14.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13 (High Sierra)	motifmatchr_1.14.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/motifmatchr
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ motifmatchr
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/motifmatchr/
包下载报告	下载数据