生物导体版本:版本(3.15)
通过评估“前体离子纯度”来评估片段化光谱的光谱质量:1)评估片段化光谱的光谱质量。2)工艺碎裂光谱。3)执行光谱匹配。什么是前体离子纯度?- 我们所说的“前体离子纯度”是对用于碎片的隔离窗口中选定的前体峰的贡献的度量。简单的计算涉及将所选前体峰的强度除以隔离窗口的总强度。在评估MS/MS光谱时,该计算是在感兴趣的MS/MS扫描之前和之后完成的,并在MS/MS采集的记录时间内插值。此外,可以去除同位素峰,去除低丰度峰,被认为对所得的MS/MS光谱的贡献有限,并且可以使用质谱仪的隔离效率来使用于计算的强度正常化。
作者:Thomas N. Lawson [AUT,CRE],Ralf Weber [CTB],Martin Jones [CTB],Julien Saint-Vanne [CTB],Andris Jankevics [CTB],Mark Viant [THS],Warwick Dunn [THS]
维护者:thomas N. Lawson
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html | R脚本 | M型 |
html | R脚本 | M型光谱数据库模式 |
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参考手册 | ||
文本 | 消息 | |
文本 | 执照 |
生物浏览 | 2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 |
版本 | 1.22.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.4(R-3.3)(5。5年) |
执照 | GPL-3 +文件执照 |
要看 | RCPP |
进口 | plyr,,,,dplyr,,,,dbplyr,,,,马格里特,,,,foreach, 平行,Dosnow,,,,Stringr,,,,MZR,,,,RESHAPE2,,,,快速积分,,,,GGPLOT2,,,,DBI,,,,rsqlite |
链接 | |
建议 | MSNBase,,,,测试,,,,XCMS,,,,生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,mspuritydata,,,,相机,,,,rpostgres,,,,rmysql |
系统要求 | |
增强 | |
URL | https://github.com/computational-metabolomics/mspurity/ |
BugReports | https://github.com/computational-metabolomics/mspurity/issues/new |
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源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/mspurity |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:包装/mspurity |
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