MSA.

DOI：10.18129 / b9.bioc.msa.

多个序列对齐

Bioconductor版本：释放（3.13）

“MSA”包为多个序列对准算法Clustalw，Clustalomega和肌肉提供统一的R / Biocumon界面。所有三种算法都集成在包装中，因此，它们不依赖于任何外部软件工具，可用于所有主要平台。多个序列对准算法通过使用乳胶封装Texshade互补的函数进行漂亮打印多个序列对齐。

作者：Enrico Bonatesta，Christoph Horejs-Kainrath，Ulrich Bodenhofer

维护者：Ulrich Bodenhofer >

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.1”）并输入：

if（！percennamespace（“biocmanager”，squilly = true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“msa”）

对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。

文件

要查看系统中安装此包版本的文档，请启动r并输入：

BROWSEVIGNETTES（“MSA”）

PDF.	r script.	MSA - 用于多个序列对齐的AN R包
PDF.		参考手册
文本		消息

细节

Biocviews.	2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯
版本	1.24.0
在生物导体中以来	BIOC 3.1（R-3.2）（6年）
执照	GPL（> = 2）
依靠	R（> = 3.1.0），方法，生物仪器（> = 2.40.0）
进口	rcpp.（> = 0.11.1），生物根系那绞喉（> = 1.20.0），S4Vectors.， 工具
链接到	rcpp.
建议	BioBase.那kn那Seqinr.那猿那潮恩
系统要求	GNU制作
加强
URL.	http://www.bioinf.jku.at/software/msa/
取决于我
进口我	淋巴结曲那odseq.
建议我	IDPR.
链接给我
建立报告

包档案包

跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。

源包	MSA_1.24.0.tar.gz.
Windows二进制文件	MSA_1.24.0.zip.
Macos 10.13（高塞拉）	MSA_1.24.0.TGZ.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/msa.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondion.org：包/ MSA
包短网址	https://biocumon.org/packages/msa/
包裹下载报告	下载统计信息