msmstests.

DOI：10.18129 / b9.bioc.msmtests.

LC-MS / MS差异表达测试

Biocometiond版本：释放（3.12）

通过光谱计数对无标记的LC-MS / MS数据进行统计测试，发现两个生物条件之间的差异表达蛋白质。有三种测试：Poisson GLM回归，准可能性GLM回归和edger封装的负二射。三种模型承认控制疏扰变量的阻止因素。确保良好的再现水平可用后测试过滤​​器，我们可以设置最小的效果大小被认为是生物的相关性，以及最丰富的状态的最低表达。

作者：Josep Gregori，Alex Sanchez和Josep Villanueva

维护者：Josep Gregori i Font

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.0”）并输入：

if（！percennamespace（“biocmanager”，squilly = true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“msmstests”）

对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。

文件

要查看系统中安装此包版本的文档，请启动r并输入：

BROWSEVIGNETTES（“MSMSTESTS”）

PDF.	r script.	MSMSTESTS：通过阻止控制批处理效果
PDF.	r script.	MSMSTESTS：测试过滤器以提高可重复性
PDF.		参考手册

细节

Biocviews.	2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯
版本	1.28.0
在生物导体中以来	BIOC 2.13（R-3.0）（7.5岁）
执照	GPL-2
依靠	r（> = 3.0.1），msnbase.那msmseda.
进口	edger.那qvalue.
链接到
建议
系统要求
加强
URL.
取决于我
进口我	msnid.
建议我	林葛普查组织
链接给我
建立报告

包档案包

跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。

源包	msmstests_1.28.0.tar.gz.
Windows二进制文件	msmstests_1.28.0.zip.
Macos 10.13（高塞拉）	msmstests_1.28.0.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/msmtests.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondion.org：包/ msmstests
包短网址	https://biocumon.org/packages/msmstests/
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