Bioconductor版本:释放(3.13)
MZR为统一的API提供给公共文件格式和解析器可用于质谱数据。它配备了一个包装器,适用于MASB随机访问解析器,用于质谱法MZXML,MZDATA和MZML文件。该软件包包含由ISB编写的原始代码以及MZML和MzientML的ProteOWIZARD库的子集。先前已在XCMS中使用NetCDF阅读代码。
作者:Bernd Fischer,Steffen Neumann,Laurent Gatto,Qiannkes Rainer
维护者:Steffen Neumann
引文(从R内,输入引文(“MZR”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“4.1”)并输入:
if(!percennamespace(“biocmanager”,squilly = true))install.packages(“biocmanager”)biocmanager ::安装(“mzr”)
对于旧版本,请参阅相应的生物导体释放。
要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:
BROWSEVIGNETTES(“MZR”)
HTML. | r script. | 探讨原料质谱和识别数据 |
PDF. | 参考手册 | |
文本 | 消息 |
Biocviews. | 2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 |
版本 | 2.26.0 |
在生物导体中以来 | BIOC 2.9(R-2.14)(9.5岁) |
执照 | 艺术-2.0 |
依靠 | rcpp.(> = 0.10.1),方法,实用 |
进口 | BioBase.那生物根系(> = 0.13.6),语言机构(> = 1.17.3),NCDF4 |
链接到 | rcpp.那Zlibbioc那RHDF5LIB.(> = 1.1.4) |
建议 | msdata.(> = 0.15.1),运行那mzid.那生物焦(> = 2.5.19),kn那XML.那RAMAMAMDOW. |
系统要求 | C ++ 11,GNU制作 |
加强 | |
URL. | https://github.com/sneumann/mzr/ |
Bugreports. | https://github.com/sneumann/mzr/issues/ |
取决于我 | msgfgui.那msnbase.那蛋白质组学 |
进口我 | 制剂瘤那autotuner.那Clumsid.那dialignr.那msnid.那MSPURITY.那峰坦坦那ProteomicsannotationHubData.那rmassbank.那西马特那Topdownr.那XCMS.那山姆斯 |
建议我 | annotationhub.那msdata.那qcmetrics.那林葛普查组织那光谱 |
链接给我 | |
建立报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。
源包 | mzr_2.26.0.tar.gz. |
Windows二进制文件 | mzr_2.26.0.zip. |
Macos 10.13(高塞拉) | mzr_2.26.0.tgz. |
源存储库 | git clone https://git.biocumon.org/packages/mzr. |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.biocondion.org:包/ Mzr |
包短网址 | https://biocumon.org/packages/mzr/ |
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