MZR.

DOI:10.18129 / b9.bioc.mzr.

用于netcdf,mzxml,mzdata和mzml和mzidentml文件的解析器(质谱数据)

Bioconductor版本:释放(3.13)

MZR为统一的API提供给公共文件格式和解析器可用于质谱数据。它配备了一个包装器,适用于MASB随机访问解析器,用于质谱法MZXML,MZDATA和MZML文件。该软件包包含由ISB编写的原始代码以及MZML和MzientML的ProteOWIZARD库的子集。先前已在XCMS中使用NetCDF阅读代码。

作者:Bernd Fischer,Steffen Neumann,Laurent Gatto,Qiannkes Rainer

维护者:Steffen Neumann ,Laurent Gatto ,Qiakng Kou

引文(从R内,输入引文(“MZR”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.1”)并输入:

if(!percennamespace(“biocmanager”,squilly = true))install.packages(“biocmanager”)biocmanager ::安装(“mzr”)

对于旧版本,请参阅相应的生物导体释放

文件

要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:

BROWSEVIGNETTES(“MZR”)

HTML. r script. 探讨原料质谱和识别数据
PDF. 参考手册
文本 消息

细节

Biocviews. 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯
版本 2.26.0
在生物导体中以来 BIOC 2.9(R-2.14)(9.5岁)
执照 艺术-2.0
依靠 rcpp.(> = 0.10.1),方法,实用
进口 BioBase.生物根系(> = 0.13.6),语言机构(> = 1.17.3),NCDF4
链接到 rcpp.ZlibbiocRHDF5LIB.(> = 1.1.4)
建议 msdata.(> = 0.15.1),运行mzid.生物焦(> = 2.5.19),knXML.RAMAMAMDOW.
系统要求 C ++ 11,GNU制作
加强
URL. https://github.com/sneumann/mzr/
Bugreports. https://github.com/sneumann/mzr/issues/
取决于我 msgfgui.msnbase.蛋白质组学
进口我 制剂瘤autotuner.Clumsid.dialignr.msnid.MSPURITY.峰坦坦ProteomicsannotationHubData.rmassbank.西马特Topdownr.XCMS.山姆斯
建议我 annotationhub.msdata.qcmetrics.林葛普查组织光谱
链接给我
建立报告

包档案包

跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。

源包 mzr_2.26.0.tar.gz.
Windows二进制文件 mzr_2.26.0.zip.
Macos 10.13(高塞拉) mzr_2.26.0.tgz.
源存储库 git clone https://git.biocumon.org/packages/mzr.
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.biocondion.org:包/ Mzr
包短网址 https://biocumon.org/packages/mzr/
包裹下载报告 下载统计信息

文件»

生物体

R./cr包裹和文件

支持»

请阅读张贴指南。将关于Biocometiond的问题发布到以下位置之一:

  • 支持网站- 关于生物导体包的问题
  • Bioc-devel.邮件列表 - 适用于包开发人员2021欧洲杯体育投注开户