Nempi

doi:10.18129/b9.bioc.nempi

从基因表达数据中推断出未观察到的扰动

生物导体版本:版本(3.15)

将输入作为对数赔率中不完整的扰动曲线和差异基因表达,并渗透了未观察到的扰动和增强观察到的扰动。通过迭代从扰动中推断网络并从网络中推断出扰动来完成推断。网络推断是通过嵌套效应模型完成的。

作者:Martin Pirkl [AUT,CRE]

维护者:Martin Pirkl

引用(从r内,输入引用(“ Nempi”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ Nempi”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Nempi”)

html R脚本 Nempi
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细节

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版本 1.4.0
在生物导体中 Bioc 3.13(R-4.1)(1年)
执照 GPL-3
依靠 r(> = 4.1),mnem
进口 E1071,,,,nnet,,,,Randomforest,,,,Naturalsort,图形,统计,utils,矩阵,,,,Epinem
链接
建议 尼特,,,,生物基因,,,,rmarkDown,,,,运行
系统要求
增强
URL https://github.com/cbg-ethz/nempi/
BugReports https://github.com/cbg-ethz/nempi/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 nempi_1.4.0.tar.gz
Windows二进制 nempi_1.4.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) NEMPI_1.4.0.TGZ
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/nempi
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/nempi
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/nempi/
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