normalize450K

DOI:10.18129 / B9.bioc.normalize450K

Illumina Infinium 450K数据预处理

Bioconductor版本:Release (3.15)

精确的测量对于研究全血样本中DNA甲基化的表观基因组范围的研究是重要的，在这些研究中，效应大小预计是很小的。450K平台经常受到批处理效应的影响，建议进行适当的预处理。这个包提供了读取和规范化450K '的函数。idat”文件。归一化校正染料偏倚和偏差相关的信号强度和甲基化探针使用局部回归。不调整探头类型偏差，以避免beta值的精度的权衡精度。

作者:Jonathan Alexander Heiss

维护者:Jonathan Alexander Heiss < Jonathan。Heiss在post .de>

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“normalize450K”)

PDF	R脚本	规范化450K数据
PDF		参考手册
文本		许可证

细节

biocViews	2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯
版本	1.24.0
在Bioconductor	BioC 3.3 (R-3.3)(6年)
许可证	BSD_2_clause +文件许可证
取决于	R (>= 3.3)，Biobase，illuminaio，quadprog
进口	跑龙套
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	normalize450K_1.24.0.tar.gz
Windows二进制	normalize450K_1.24.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	normalize450K_1.24.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/normalize450K
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/normalize450K
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/normalize450K/
软件包下载报告	下载数据