诺考

DOI:10.18129 / b9.bioc.normr.

Chip-SEQ数据中的归一化和差异呼叫

Bioconductor版本:释放(3.13)

芯片-SEQ和相似数据的强大归一化和差异调用过程。读取计数作为具有用户指定数量的组件的二项式混合模型来共同建模。拟合背景估计估计在某些地区的富集作用,因此代表了适当的零假设。该稳健的背景用于识别显着富集或耗尽的区域。

作者:Johannes Helmuth [AUT,CRE],Ho-Ryun Chung [Aut]

维护者:Johannes Helmuth

引文(从R内,输入引文(“NORMR”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.1”)并输入:

if(!qualocmanage(“biocmanager”,squiatly = true))install.packages(“biocmanager”)biocmanager ::安装(“remarr”)

对于旧版本,请参阅相应的生物导体释放

文件

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BROWSEVIGNETTES(“NORMR”)

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版本 1.18.0.
在生物导体中以来 BIOC 3.4(R-3.3)(4.5岁)
执照 GPL-2
依靠 r(> = 3.3.0)
进口 方法,统计,Util,Grdevices,并行,genomeinfodb.Genomicranges.绞喉rcpp.(> = 0.11),qvalue.(> = 2.2),Bamsignals.(> = 1.4),rtracklayer.(> = 1.32)
链接到 rcpp.
建议 生物焦testthat.(> = 1.0),knRAMAMAMDOW.
系统要求 C ++ 11.
加强 生物相投
URL. https://github.com/your-highness/normr.
Bugreports. https://github.com/your-highness/normr/issues.
取决于我
进口我
建议我
链接给我
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包档案包

跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。

源包 normr_1.18.0.tar.gz.
Windows二进制文件 normr_1.18.0.zip.
Macos 10.13(高塞拉) NORMR_1.18.0.TGZ.
源存储库 git clone https://git.biocumon.org/packages/normr.
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.biocondudard.org:packages / normr
包短网址 https://biocumon.org/packages/normr/
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