nullranges

doi:10.18129/b9.bioc.nullranges

通过引导或协变量匹配产生无效范围

生物导体版本:版本(3.15)

用于生成代表零假设的范围集的模块化包装。这些可以采用范围的自举样品的形式(使用Bickel等人2010年的Block Bootstrap框架),也可以使用一个或多个协变量匹配的控制范围。Nullranges设计为与其他包装相互处理,用于分析基因组重叠富集,包括Plyranges Bioconductor套件。

作者:迈克尔·洛夫[AUT,CRE],Wancen MU [AUT],埃里克·戴维斯[aut],道格拉斯·菲尔斯蒂尔[aut],Stuart Lee [aut],Mikhail Dozmorov [CTB],Tim Triche [CTB],CZI [FND]

维护者:迈克尔·洛夫(Michael Love)

引用(从r内,输入引用(“ nullranges”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ nullranges”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ nullranges”)

html R脚本 0. nullranges简介
html R脚本 1. Matchranges的概述
html R脚本 2.案例研究I:CTCF占用
html R脚本 3.案例研究II:CTCF方向
html R脚本 4.分段块引导程序
html R脚本 5.未分段的块bootstrap
PDF 参考手册
文本 消息

细节

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版本 1.2.0
在生物导体中 Bioc 3.14(R-4.1)(1年)
执照 GPL-3
要看
进口 统计,iranges,,,,基因组机,,,,GenomeInfodB, 方法,rlang,,,,S4VECTORS,,,,,,,,互动集,,,,GGPLOT2,grdevices,plyranges,,,,KS,,,,Speedglm,,,,Data.Table,,,,进步,,,,Ggridges
链接
建议 测试,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,DNACOPIGY,,,,rcpphmm,,,,AnnotationHub,,,,nullrangesdata,,,,排除,,,,Ensembldb,,,,ensdb.hsapiens.v86,,,,微实验,,,,拼布,,,,Plotgardener,,,,马格里特,,,,花花公子,,,,
系统要求
增强
URL https://nullranges.github.io/nullranges
BugReports https://support.bioconductor.org/t/nullranges/
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 nullranges_1.2.0.tar.gz
Windows二进制 nullranges_1.2.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) nullranges_1.2.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/nullranges
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/nullranges
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/nullranges/
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