openPrimeRui

DOI:10.18129 / B9.bioc.openPrimeRui

多重PCR引物设计与分析的闪亮应用

Bioconductor版本:发行版(3.16)

一个闪亮的应用提供方法,设计,评估,和比较引物集的多重聚合酶链反应。引物是通过解决集合覆盖问题来设计的,这样覆盖的模板序列的数量可以用尽可能小的引物集最大化。为了保证生成高质量的引物,只选择满足其理化性质约束的引物。

作者:Matthias Döring [aut, cre], Nico Pfeifer [aut]

维护者:Matthias Döring < Matthias -doering at gmx.de>

引文(从R内,输入引用(“openPrimeRui”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“openPrimeRui”)

超文本标记语言 R脚本 openPrimeRui
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯
版本 1.20.0
在Bioconductor BioC 3.6 (R-3.4)(5年)
许可证 GPL-2
取决于 R (>= 4.0.0),openPrimeR(> = 0.99.0)
进口 闪亮的(> = 1.0.2中),shinyjs(> = 0.9),shinyBS(> = 0.61),DT(> = 0.2),rmarkdown(> = 1.0)
链接
建议 knitr(> = 1.13)
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包 openPrimeRui_1.20.0.tar.gz
Windows二进制 openPrimeRui_1.20.0.zip
macOS二进制文件(x86_64) openPrimeRui_1.20.0.tgz
macOS二进制文件(arm64) openPrimeRui_1.20.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/openPrimeRui
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/openPrimeRui
生物包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/openPrimeRui/
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/openPrimeRui/
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