pcamethods

doi:10.18129/b9.bioc.pcamethods

PCA方法的集合

生物导体版本:版本(3.15)

提供贝叶斯PCA,概率PCA,NIPALS PCA,逆非线性PCA和常规SVD PCA。包括基于群集的基于群集的方法进行比较。BPCA,PPCA和NIPALSPCA可用于在不完整的数据上执行PCA,以及准确的缺少价值估计。还提供了一组用于打印和绘制结果的方法。所有PCA方法均使用相同的数据结构(PCARES)为PCA结果提供了共同的接口。在德国戈尔姆的Max-Planck分子植物生理学研究所发起。

作者:Wolfram Stacklies,Henning Redestig,Kevin Wright

维护者:Henning Redestig

引用(从r内,输入引用(“ pcamethods”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ pcamethods”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ pcamethods”)

PDF R脚本 与异常值数据
PDF R脚本 介绍
PDF R脚本 缺少价值插补
PDF 参考手册

细节

生物浏览 2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯
版本 1.88.0
在生物导体中 Bioc 1.9(R-2.4)(15。5年)
执照 GPL(> = 3)
要看 生物酶, 方法
进口 生物基因,,,,RCPP(> = 0.11.3),大量的
链接 RCPP
建议 矩阵,,,,格子,,,,GGPLOT2
系统要求 RCPP
增强
URL https://github.com/hredestig/pcamethods
BugReports https://github.com/hredestig/pcamethods/issues
取决于我 deconrnaseq
进口我 自治,,,,共识,,,,达帕尔,,,,命运,,,,弗雷泽,,,,,,,,Matrixqcvis,,,,MSNBase,,,,MSPREP,,,,Multibac,,,,校长,,,,phosr,,,,PMP,,,,SCDE,,,,躯体签名
建议我 mscoreutils,,,,mtbls2,,,,qfeatures,,,,QMTools
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 pcamethods_1.88.0.tar.gz
Windows二进制 pcamethods_1.88.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) pcamethods_1.88.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/pcamethods
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/pcamethods
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/pcamethods/
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