PCXN

doi:10.18129/b9.bioc.pcxn

利用PCXNDATA软件包探索,分析和可视化功能

生物导体版本:版本(3.13)

发现单个途径/基因集的相关途径/基因集或发现多个途径/基因集之间的相关关系。绘制热图或创建查询网络,并提取可用集合中发现的每个途径/基因集的成员(MSIGDB H Hallmark,MSIGDB C2 C2 canonical Pathways,MSIGDB C5 GO BP和Pathprint)。

作者:Sokratis Kariotis,Yered Pita-Juarez,Winston Hide,Wenbin Wei

维护者:sokratis kariotis

引用(从r内,输入引用(“ PCXN”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.1”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ pcxn”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ PCXN”)

PDF R脚本 PCXN
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文本 执照

细节

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版本 2.14.0
在生物导体中 Bioc 3.6(R-3.4)(3.5岁)
执照 麻省理工学院 +文件执照
要看 r(> = 3.4),pcxndata
进口 方法,grdevices,utils,pheatmap
链接
建议 Igraph,,,,注释,,,,org.hs.eg.db
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我 pcxndata
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 pcxn_2.14.0.tar.gz
Windows二进制 pcxn_2.14.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) pcxn_2.14.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/pcxn
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/pcxn
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/pcxn/
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