扰动

doi:10.18129/b9.bioc.perturbatr

这个包是弃用。它可能会从生物导体中取出。请参考包装终止指南了解更多信息。

高通量遗传扰动筛选的统计分析

生物导体版本:版本(3.15)

远程尿布做对由多个筛选组成的集成数据集进行大规模遗传扰动筛选的阶段分析。对于多个集成的扰动筛选,拟合了不同生物条件之间的方差的层次模型。然后,使用网络传播算法进一步扩展了基因效应的列表,以纠正虚假负面。

作者:Simon Dirmeier [AUT,CRE]

维护者:Simon Dirmeier

引用(从r内,输入引用(“扰动”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ perturbatr”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

PDF 参考手册

细节

生物浏览 2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯
版本 1.16.0
在生物导体中 Bioc 3.7(R-3.5)(4年)
执照 GPL-3
要看 R(> = 3.5),方法,统计
进口 dplyr,,,,GGPLOT2,,,,花花公子,,,,断言,,,,LME4,花键,Igraph,,,,foreach, 平行,多帕尔,,,,diffusr,,,,懒惰,,,,蒂布尔,网格,utils,图形,,,,,马格里特,,,,公式,,,,rlang
链接
建议 测试,,,,林特,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,生物使用
系统要求
增强
URL https://github.com/cbg-ethz/perturbatr
BugReports https://github.com/cbg-ethz/perturbatr/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包
Windows二进制
MacOS 10.13(高山脉)
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/perturbatr
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/perturbatr
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/perturbatr/
软件包下载报告 下载统计

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