plyranges

DOI:10.18129 / B9.bioc.plyranges

一个流畅的界面操作基因组范围

生物导体版本:发布(3.13)

一个类似dplyr的接口,用于与常见的Bioconductor类Ranges和GenomicRanges交互。通过提供一种合乎语法且一致的方式来操作这些类,Bioconductor新用户的可访问性有望得到提高。

作者:Stuart Lee, Michael Lawrence [aut, ctb], Dianne Cook [aut, ctb], Spencer Nystrom [ctb]

维护者:Stuart Lee < Lee。年代在wehi.edu.au >

引文(从R中输入引用(“plyranges”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!安装BiocManager::install("plyranges")

有关较旧版本的R,请参阅适当的Bioconductor释放

文档

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browseVignettes(“plyranges”)

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细节

biocViews 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯
版本 1.12.0
Bioconductor自 BioC 3.7 (R-3.5)(3年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (> = 3.5),BiocGenericsIRanges(> = 2.12.0),GenomicRanges(> = 1.28.4)
进口 方法,dplyrrlang(> = 0.2.0),magrittrtidyselect(> = 1.0.0),rtracklayerGenomicAlignmentsGenomeInfoDbRsamtoolsS4Vectors(> = 0.23.10),跑龙套
链接
建议 knitrBiocStylermarkdowntestthat(> =魅惑,HelloRangesHelloRangesDataBSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19pasillaBamSubsetcovrggplot2
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports https://github.com/sa-lee/plyranges
取决于我
进口我 BUSpaRsedasperfluentGenomicsInPASmethylCCmulticrisprnearBynding
建议我 模因StructuralVariantAnnotation
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包 plyranges_1.12.0.tar.gz
Windows二进制 plyranges_1.12.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) plyranges_1.12.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/plyranges
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ plyranges
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/plyranges/
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  • Bioc-devel邮件列表-为包开发人员2021欧洲杯体育投注开户