Bioconductor版本:释放(3.13)
通过集成H3K4ME3和POL II的数据以及组合在命令行和图形界面中的节约级别和序列特征的组合来识别MIRNA的TSSS的快速,便捷的工具,并实现了比以前的非-Cell特定方法MiRNA TSSS。
作者:Pumin Li [Aut,Cre],qi xu [aut],jie li [aut],金王[aut]
维护者:Pumen Li
引文(从R内,输入引文(“妊娠期”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“4.1”)并输入:
if(!perceneNamespace(“biocmanager”,squilly = true))install.packages(“biocmanager”)biocmanager ::安装(“jigirtss”)
对于旧版本,请参阅相应的生物导体释放。
要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:
BROWSEVIGNETTES(“妊娠期”)
HTML. | r script. | 妊娠期 |
PDF. | 参考手册 | |
文本 | 消息 |
Biocviews. | 2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 |
版本 | 1.10.0 |
在生物导体中以来 | BIOC 3.8(R-3.5)(2.5岁) |
执照 | GPL-2 |
依靠 | r(> = 3.5.0) |
进口 | Genomicranges.(> = 1.32.2),S4Vectors.(> = 0.18.2),rtracklayer.(> = 1.40.3),dplyr.(> = 0.7.6),stringr.(> = 1.3.1),Tidyr.(> = 0.8.1),生物仪器(> = 2.48.0),邮风(> = 0.2.5),bsgenome.hsapiens.ucsc.hg38(> = 1.4.1),phastcons100way.ucsc.hg38(> = 3.7.1),基因组织(> = 1.4.1),闪亮的(> = 1.0.5),GVIZ.(> = 1.24.0),生物根系(> = 0.26.0),绞喉(> = 2.14.10),TFBStools.(> = 1.18.0),JASPAR2018(> = 1.1.1),娇媚(> = 1.4.2),R.utils.(> = 2.6.0),统计数据,utils |
链接到 | |
建议 | kn那RAMAMAMDOW. |
系统要求 | |
加强 | |
URL. | https://github.com/ipumin/primitrs. |
Bugreports. | http://github.com/ipumin/primirtss/issues. |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接给我 | |
建立报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。
源包 | primirtss_1.10.0.tar.gz. |
Windows二进制文件 | primirtss_1.10.0.zip. |
Macos 10.13(高塞拉) | primirtss_1.10.0.tgz. |
源存储库 | git clone https://git.biocumon.org/packages/primirtss. |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.biocondudard.org:包装/初步 |
包短网址 | https://biocumon.org/packages/primirtss/ |
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