妊娠期

DOI:10.18129 / b9.bioc.prijrss.

Pri-miRNA转录开始网站的预测

Bioconductor版本:释放(3.13)

通过集成H3K4ME3和POL II的数据以及组合在命令行和图形界面中的节约级别和序列特征的组合来识别MIRNA的TSSS的快速,便捷的工具,并实现了比以前的非-Cell特定方法MiRNA TSSS。

作者:Pumin Li [Aut,Cre],qi xu [aut],jie li [aut],金王[aut]

维护者:Pumen Li

引文(从R内,输入引文(“妊娠期”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.1”)并输入:

if(!perceneNamespace(“biocmanager”,squilly = true))install.packages(“biocmanager”)biocmanager ::安装(“jigirtss”)

对于旧版本,请参阅相应的生物导体释放

文件

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Biocviews. 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯
版本 1.10.0
在生物导体中以来 BIOC 3.8(R-3.5)(2.5岁)
执照 GPL-2
依靠 r(> = 3.5.0)
进口 Genomicranges.(> = 1.32.2),S4Vectors.(> = 0.18.2),rtracklayer.(> = 1.40.3),dplyr.(> = 0.7.6),stringr.(> = 1.3.1),Tidyr.(> = 0.8.1),生物仪器(> = 2.48.0),邮风(> = 0.2.5),bsgenome.hsapiens.ucsc.hg38(> = 1.4.1),phastcons100way.ucsc.hg38(> = 3.7.1),基因组织(> = 1.4.1),闪亮的(> = 1.0.5),GVIZ.(> = 1.24.0),生物根系(> = 0.26.0),绞喉(> = 2.14.10),TFBStools.(> = 1.18.0),JASPAR2018(> = 1.1.1),娇媚(> = 1.4.2),R.utils.(> = 2.6.0),统计数据,utils
链接到
建议 knRAMAMAMDOW.
系统要求
加强
URL. https://github.com/ipumin/primitrs.
Bugreports. http://github.com/ipumin/primirtss/issues.
取决于我
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建议我
链接给我
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包档案包

跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。

源包 primirtss_1.10.0.tar.gz.
Windows二进制文件 primirtss_1.10.0.zip.
Macos 10.13(高塞拉) primirtss_1.10.0.tgz.
源存储库 git clone https://git.biocumon.org/packages/primirtss.
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.biocondudard.org:包装/初步
包短网址 https://biocumon.org/packages/primirtss/
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