概要

DOI:10.18129 / b9.bioc.probatch.

蛋白质组学中批量效应的诊断工具

Biocometiond版本:释放(3.12)

这些工具有助于在高通量实验中进行批量效果分析和校正。它主要是用于质谱蛋白质组学(直接/条线)的开发,但也可以适用于具有较小适应的大多数OMIC数据。该包装包含诊断功能(蛋白质组/基因组 - 宽和特征级),校正(归一化和批量效果校正)和质量控制。还包括非线性拟合的方法以处理复杂的质谱特异性信号漂移。

作者:Jelena Cuklina ,Chloe H. Lee ,Patrick Pedrioli

维护者:Chloe H. Lee

引文(从R内,输入引文(“概要”)):

安装

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版本 1.6.0
在生物导体中以来 BIOC 3.9(R-3.6)(2年)
执照 GPL-3.
依靠 r(> = 3.6)
进口 BioBase.控制dplyr.data.table.GGFortify.ggplot2.,grdevices,lazyeval.拉保赛Magrittr.Pheatmap.预处理核邮风PVCArcolorbrewer.重塑2.rlang.,统计,SVA.Tidyr.娇媚,工具,实用程序,viridis.Wesanderson.WGCNA
链接到
建议 knRAMAMAMDOW.devtools.ggpubr.GTABLE.格拉底Roxygen2.testthat.(> = 2.1.0),拼写
系统要求
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URL. https://github.com/symbioticme/probatch.
Bugreports. https://github.com/symbioticme/probatch/issues.
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源包 probatch_1.6.0.tar.gz.
Windows二进制文件 probatch_1.6.0.zip.
Macos 10.13(高塞拉) probatch_1.6.0.tgz.
源存储库 git clone https://git.biocumon.org/packages/probatch.
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包/概要
包短网址 https://biocumon.org/packages/probatch/
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