pwOmics

DOI:10.18129 / B9.bioc.pwOmics

基于路径的组学数据集成

生物导体版本:发布(3.13)

pwOmics基于预先分析的用户指定的差异基因/转录本和磷蛋白列表，对匹配的组学数据集进行基于路径的level-specific数据比较。单独对磷酸化蛋白质组数据进行下游分析，包括通路鉴定、转录因子鉴定和目的基因鉴定，而不是以基因或转录本信息为基础进行上游分析，以鉴定上游转录因子和潜在的蛋白质组调控因子。跨平台对比分析通过提供静态和动态分析工具进行数据集成，实现单时间点实验和时间序列实验的综合分析。此外，它还提供了基于数据集成识别单个信令轴的功能。

作者:Astrid Wachter

维护人员:Maren site

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!安装BiocManager::install("pwOmics")

有关较旧版本的R，请参阅适当的Bioconductor释放．

文档

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细节

biocViews	2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯
版本	1.24.0
Bioconductor自	BioC 3.1 (R-3.2)(6年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (> = 3.2)
进口	data.table，rBiopaxParser，igraph，STRINGdb、图形、gplots，Biobase，BiocGenerics，AnnotationDbi，biomaRt，AnnotationHub，GenomicRanges，图， grDevices, stats, utils
链接
建议	ebdbNet，纵向，Mfuzz
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
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构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	pwOmics_1.24.0.tar.gz
Windows二进制	pwOmics_1.24.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	pwOmics_1.24.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/pwOmics
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ pwOmics
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/pwOmics/
包下载报告	下载数据