qmtools

DOI:10.18129 / B9.bioc.qmtools

定量代谢组学数据处理工具

Bioconductor版本:发行版(3.15)

qmtools(定量代谢组学工具)包提供了使用标准summarizeexperiment类处理定量代谢组学数据的基本工具。这包括一些功能，如:归一化、特征过滤、特征聚类、降维和可视化，以帮助用户为统计分析准备数据。这个包中的几个函数也可以用于其他类型的组学数据。

作者:Jaehyun Joo [aut, cre]， Blanca Himes [aut]

维护者:Jaehyun Joo

安装

要安装此包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("qmtools")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“qmtools”)

超文本标记语言	R脚本	定量代谢组学数据处理
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯
版本	1.0.0
Bioconductor自	BioC 3.15 (R-4.2)(< 6个月)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 4.2.0),SummarizedExperiment
进口	rlang，ggplot2，拼接而成，的热图、方法、MsCoreUtils统计数据,igraph，VIM，尺度、grDevices、图形
链接
建议	limma，Rtsne，missForest，vsn，pcaMethods，请，MsFeatures，嫁祸于，imputeLCMD，nlme，testthat(> = 3.0.0),BiocStyle，knitr，rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/HimesGroup/qmtools
BugReports	https://github.com/HimesGroup/qmtools/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	qmtools_1.0.0.tar.gz
Windows二进制	qmtools_1.0.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	qmtools_1.0.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/qmtools
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ qmtools
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/qmtools/
包下载报告	下载数据