QPGraph..

DOI:10.18129 / b9.bioc.qpgraph..

高通量基因组学数据估计遗传和分子调节网络

Biocometiond版本:释放(3.12)

从高通量表达和基因分型测定中估算基因和EQTL网络。

作者:Robert Castelo [Aut,Cre],Alberto Roverato [Aut]

维护者:Robert Castelo

引文(从R内,输入引文(“QPGraph”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.0”)并输入:

if(!properenamespace(“biocmanager”,squilly = true))install.packages(“biocmanager”)biocmanager ::安装(“qpgraph”)

对于旧版本,请参阅相应的生物导体释放

文件

要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:

BROWSEVIGNETTES(“QPGRAPH”)

PDF. BasicUsersguide.pdf.
PDF. r script. 使用QPGraph估计EQTL网络
PDF. r script. 使用QPGraph的反向工程师转录规范网络
PDF. r script. 使用QPGraph模拟分子调节网络
PDF. 参考手册
文本 消息

细节

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版本 2.24.3.
在生物导体中以来 BIOC 2.4(R-2.9)(12年)
执照 GPL(> = 2)
依靠 r(> = 3.5)
进口 方法,平行,矩阵(> = 1.0),网格,注释图形(> = 1.45.1),BioBase.S4Vectors.生物相投annotationdbi.绞喉Genomeinfodb.Genomicranges.基因组法mvtnorm.QTL.rghrachviz
链接到
建议 运行生物根系生物焦Genefilter.org.eck12.eg.db.rlecuyer.类别古司裤
系统要求
加强
URL. https://github.com/rcastelo/qpgraph..
Bugreports. https://github.com/rcastelo/rcastelo/issues.
取决于我
进口我 剪刀
建议我
链接给我
建立报告

包档案包

跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。

源包 qpgraph_2.24.3.tar.gz.
Windows二进制文件 qpgraph_2.24.3.zip.(32-&64位)
Macos 10.13(高塞拉) qpgraph_2.24.3.tgz.
源存储库 git clone https://git.biocumon.org/packages/qpgraph..
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.biocondudard.org:包/ Qpgraph
包短网址 https://biocumon.org/packages/qpgraph/
包裹下载报告 下载统计信息
BIOC 3.12的旧源包 源档案

文件»

生物体

R./cr包裹和文件

支持»

请阅读张贴指南。将关于Biocometiond的问题发布到以下位置之一:

  • 支持网站- 关于生物导体包的问题
  • Bioc-devel.邮件列表 - 适用于包开发人员2021欧洲杯体育投注开户