qrqc

DOI:10.18129 / B9.bioc.qrqc

快速阅读质量控制

Bioconductor版本:Release (3.15)

快速扫描读取并收集基本频率和质量频率、读取长度、位置k-mers和频繁序列的统计信息。生成用于质量控制管道的统计数据的图形输出，以及可选的HTML质量报告。S4 sequencsummarmary对象允许围绕收集到的数据编写特定的测试和功能。

作者:文斯·布法罗

维护者:Vince Buffalo

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“qrqc”)

PDF	R脚本	使用qrqc包收集关于序列质量的信息
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯
版本	1.50.0
在Bioconductor	BioC 2.8 (R-2.13)(11年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	重塑，ggplot2，Biostrings，biovizBase，酿造，xtable，testthat
进口	重塑，ggplot2，Biostrings，biovizBase、图形、方法、plyr,统计数据
链接	Rhtslib(> = 1.15.3)
建议
SystemRequirements	GNU使
增强了
URL	http://github.com/vsbuffalo/qrqc
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	qrqc_1.50.0.tar.gz
Windows二进制	qrqc_1.50.0.zip(64位)
macOS 10.13 (High Sierra)	qrqc_1.50.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/qrqc
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/qrqc
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/qrqc/
软件包下载报告	下载数据