彻底甲基化

DOI:10.18129 / b9.bioc.recountmethylation

访问和分析DNA甲基化数据库汇编

Bioconductor版本:释放(3.13)

访问DNA甲基化阵列数据库的交叉研究汇编。可以使用提供的功能下载和访问数据库文件。关于数据库文件类型(HDF5和HDF5-SummarizedExperiment),摘要化表明和数据处理,验证和分析的示例,可以在包装中获取。欧洲杯2021体育彩票请注意包装负载上的免责声明,并查阅主要稿件以获取更多信息。

作者:Sean K Maden [Cre,Aut],Reid f Thompson [Aut],kasper d hansen [aut],abhinav nellore [aut]

维护者:Sean K Maden

引文(从R内,输入引文(“求助甲基化”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.1”)并输入:

if(!percennamespace(“biocmanager”,静静= true))install.packages(“biocmanager”)biocmanager :: install(“recountmethylation”)

对于旧版本,请参阅相应的生物导体释放

文件

要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:

BROWSEVIGNETTES(“透露甲基化”)

HTML. r script. 数据分析
HTML. r script. reountmethylation用户指南
PDF. 参考手册
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细节

Biocviews. 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯
版本 1.2.0
在生物导体中以来 BIOC 3.12(R-4.0)(0.5岁)
执照 艺术-2.0
依靠 r(> = 4.0.0)
进口 Minfi.HDF5Array.RHDF5.S4Vectors.,utils,方法,rcurl.R.utils.biocfilecache.
链接到
建议 kntestthat.ggplot2.格拉底RAMAMAMDOW.生物焦Genomicranges.林马实验室annotationhub.
系统要求
加强
URL. https://github.com/metamaden/recountmethylation
Bugreports. https://github.com/metamaden/recountmethylation/issues.
取决于我
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链接给我
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包档案包

跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。

源包 revountmethylation_1.2.0.tar.gz.
Windows二进制文件 reountmethylation_1.1.5.zip.
Macos 10.13(高塞拉) revountmethylation_1.2.0.tgz.
源存储库 git clone https://git.biocumon.org/packages/recountmethylation
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.biocondudard.org:包/求替代
包短网址 https://biocumon.org/packages/recountmethylation/
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