- 家
- Biocumon 3.12.
- 软件包
- RegionReport.
RegionReport.
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DOI：10.18129 / b9.bioc.regionreport.
为一组基因组区域或DESEQ2 / EDGER结果生成HTML或PDF报告
Biocometiond版本：释放（3.12）
生成HTML或PDF报告以探索一组区域，例如通过Dercinder执行的基对分辨率的RNA-SEQ数据的注释 - 无止境表达分析结果。您还可以为DESEQ2或EDGER结果创建报告。
作者：Leonardo Collado-Torres [Aut，CRE]
，Andrew E. Jaffe [Aut]，Jeffrey T. Leek [Aut，THS]
维护者：Leonardo Collado-Torres
引文（从R内，输入引文（“RegionReport”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.0”）并输入：
if（！percennamespace（“biocmanager”，squilly = true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“RegionReport”）
对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。
文件
要查看系统中安装此包版本的文档，请启动r并输入：
Browsevignettes（“RegionReport”）
| HTML. | r script. | 使用Bumphunter结果的示例报告 |
| HTML. | r script. | 地区重新介绍 |
| PDF. | 参考手册 | |
| 文本 | 消息 |
细节
| Biocviews. | 2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 |
| 版本 | 1.24.2 |
| 在生物导体中以来 | BIOC 3.0（R-3.1）（6.5岁） |
| 执照 | 艺术-2.0 |
| 依靠 | r（> = 3.2） |
| 进口 | 生物焦（> = 2.5.19），德内捷德（> = 1.2.5），畸形那deseq2.那Genomeinfodb.那Genomicranges.那kn（> = 1.6），knittbootstrap.（> = 0.9.0），方法，refmanager.那RAMAMAMDOW.（> = 0.9.5），S4Vectors.那概括分析，实用程序 |
| 链接到 | |
| 建议 | Biocmanager.那Biovizbase.那Bumphunter.（> = 1.7.6），derfinderplot（> = 1.3.2），sessioninfo.那DT.那edger.那GGBIO.（> = 1.35.2），ggplot2.， 网格，格拉底那绞喉那mgcv.那帕西拉那Pheatmap.那rcolorbrewer.那txdb.hsapiens.ucsc.hg19.knowngene.那晶须 |
| 系统要求 | |
| 加强 | |
| URL. | https://github.com/leekgroup/regionreport. |
| Bugreports. | https://support.biocumon.org/t/regionreport/ |
| 取决于我 | |
| 进口我 | revountworkflow. |
| 建议我 | 叙事 |
| 链接给我 | |
| 建立报告 |
包档案包
跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。
| 源包 | RegionReport_1.24.2.tar.gz. |
| Windows二进制文件 | RegionReport_1.24.2.zip. |
| Macos 10.13（高塞拉） | RegionReport_1.24.2.tgz. |
| 源存储库 | git clone https://git.biocumon.org/packages/regionreport. |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.biocondion.org：包/区域报告 |
| 包短网址 | https://biocumon.org/packages/regionreport/ |
| 包裹下载报告 | 下载统计信息 |
| BIOC 3.12的旧源包 | 源档案 |
