regsplice.

DOI:10.18129 / b9.bioc.regsplice.

L1 - 基于正规化的差分剪接方法

Biocometiond版本:释放(3.12)

使用L1正则化(套索)在RNA-SEQ和外显子微阵列数据中检测差分剪接(差动外显子使用)的统计方法,以提高功率。

作者:Lukas M. Weber [Aut,CRE]

维护者:Lukas M. Weber

引文(从R内,输入引文(“Regsplice”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.0”)并输入:

if(!percennamespace(“biocmanager”,squilly = true))install.packages(“biocmanager”)biocmanager ::安装(“regsplice”)

对于旧版本,请参阅相应的生物导体释放

文件

要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:

Browsevignettes(“Regsplice”)

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PDF. 参考手册
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文本 执照

细节

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版本 1.16.0
在生物导体中以来 BIOC 3.4(R-3.3)(4.5岁)
执照 mit +文件执照
依靠
进口 glmnet.概括分析S4Vectors.林马edger.,统计,pbapply.,utils,方法
链接到
建议 testthat.生物焦knRAMAMAMDOW.
系统要求
加强
URL. https://github.com/lmweber/regsplice.
Bugreports. https://github.com/lmweber/regsplice/issues.
取决于我
进口我
建议我
链接给我
建立报告

包档案包

跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。

源包 Regsplice_1.16.0.tar.gz.
Windows二进制文件 Regsplice_1.16.0.zip.
Macos 10.13(高塞拉) Regsplice_1.16.0.tgz.
源存储库 git clone https://git.biocumon.org/packages/regsplice.
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.biocondion.org:包/ regsplice
包短网址 https://biocumon.org/packages/regsplice/
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文件»

生物体

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支持»

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  • Bioc-devel.邮件列表 - 适用于包开发人员2021欧洲杯体育投注开户