rfarm

doi:10.18129/b9.bioc.rfarm

RFAM数据库的R接口

生物导体版本:版本(3.13)

RFARM为RNA家族的RFAM数据库提供了客户端接口。可以检索的数据包括RNA家族,二级结构图像,协方差模型,每个家族中的序列,对dot-bracket格式中识别族的鉴定和二级结构的比对。

作者:Lara出售Vidal,Rafael Ayala,Guy-Bart Stan,Rodrigo Ledesma-Amaro

维护者:Lara在imperial.ac.uk上出售vidal

引用(从r内,输入引用(“ rfarm”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.1”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ rfarm”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ rfarm”)

html R脚本 rfarm
PDF 参考手册
文本 消息

细节

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版本 1.4.0
在生物导体中 Bioc 3.11(R-4.0)(1年)
执照 GPL-3
要看
进口 httr,,,,Stringi,,,,RSVG,,,,魔术,,,,Data.Table,,,,生物弦,utils,rvest,,,,XML2,,,,iranges,,,,S4VECTORS
链接
建议 R4RNA,,,,,,,,尼特,,,,生物使用,,,,rmarkDown,,,,生物基因
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 rfarm_1.4.0.tar.gz
Windows二进制 rfarm_1.4.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) rfarm_1.4.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rfarm
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/rfarm
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/rfarm/
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