RGSEPD.

DOI：10.18129 / b9.bioc.rgsepd.

基因集富集/投影显示

Biocometiond版本：释放（3.12）

R / GSEPD是一种用于通过自动化差异表达（具有DESEQ2）的rnave歧视转录组样本（RNA-SEQ计数的RNA-SEQ计数的矩阵），然后基因设定富集（用Goseq），最后是N维投影以定量每个样品的方法是治疗组的方式。

作者：Karl STAMM

维护者：Karl stamm

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.0”）并输入：

if（！perceneNamespace（“biocmanager”，squilly = true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“rgsepd”）

对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。

文件

要查看系统中安装此包版本的文档，请启动r并输入：

BROWSEVIGNETTES（“RGSEPD”）

PDF.	r script.	RGSEPD包的介绍
PDF.		参考手册
文本		自述
文本		消息

细节

Biocviews.	2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯
版本	1.22.0
在生物导体中以来	BIOC 3.1（R-3.2）（6年）
执照	GPL-3.
依靠	r（> = 4.0.0），deseq2.那Goseq.（> = 1.28）
进口	贡献那生物雕那org.hs.eg.db.那go.db.那概括分析那哈希那annotationdbi.
链接到
建议	靴子， 工具，生物根系那kn那xtable.
系统要求
加强
URL.
取决于我
进口我
建议我
链接给我
建立报告

包档案包

跟随安装在r会话中使用此包的说明。

源包	rgsepd_1.22.0.tar.gz.
Windows二进制文件	rgsepd_1.22.0.zip.
Macos 10.13（高塞拉）	rgsepd_1.22.0.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/rgsepd.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondion.org：包/ rgsepd
包短网址	https://biocumon.org/packages/rgsepd/
包裹下载报告	下载统计信息