Bioconductor版本:版本(3.13)
这个包是为了模型的基因检测模式scRNA-seq通过二次因子分析模型。这个模型允许用户进入一个单元级别协变量矩阵X和基因水平占讨厌方差协变量矩阵Q (e。g批效果),它将输出一个低维嵌入矩阵下游分析。
作者:李Ruoxin (aut (cre),杰拉尔德Quon (aut)
维护人员:李Ruoxin < uskli ucdavis.edu >
从内部引用(R,回车引用(“scBFA”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“scBFA”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“scBFA”)
HTML | R脚本 | 为scRNA-seq基因检测分析 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 | |
文本 | 许可证 |
biocViews | 2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 |
版本 | 1.6.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.10 (r - 3.6)(1.5年) |
许可证 | GPL-3 +文件许可证 |
取决于 | R (> = 3.6) |
进口 | SingleCellExperiment,SummarizedExperiment,修拉,质量,zinbwave统计数据,连系动词,ggplot2,DESeq2、跑龙套、网格的方法,矩阵 |
链接 | |
建议 | knitr,rmarkdown,testthat,Rtsne |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/ucdavis/quon-titative-biology/BFA |
BugReports | https://github.com/ucdavis/quon-titative-biology/BFA/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。
源包 | scBFA_1.6.0.tar.gz |
Windows二进制 | scBFA_1.6.0.zip |
macOS 10.13(高山脉) | scBFA_1.6.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/scBFA |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ scBFA |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/scBFA/ |
包下载报告 | 下载数据 |
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