scFeatureFilter

DOI:10.18129 / B9.bioc.scFeatureFilter

一种基于相关的单细胞RNAseq数据质量滤波方法

Bioconductor版本:发行版(3.15)

在Joshi实验室开发的基于相关的方法的R实现，用于分析和过滤处理过的单细胞RNAseq数据。它返回一个过滤后的数据版本，只包含不受系统噪声影响的基因表达值。

作者:Angeles Arzalluz-Luque [aut]， Guillaume Devailly [aut, cre]， Anagha Joshi [aut]

维护者:Guillaume Devailly

安装

要安装此包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("scFeatureFilter")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“scFeatureFilter”)

超文本标记语言	R脚本	介绍scFeatureFilter
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文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯
版本	1.16.0
Bioconductor自	BioC 3.7 (R-3.5)(4年)
许可证	麻省理工学院+文件许可证
取决于	R (> = 3.6)
进口	dplyr(> = 0.7.3),ggplot2(> =魅惑,magrittr(> = 1.5),rlang(> = 0.1.2),宠物猫(>= 1.3.4)，统计，方法
链接
建议	testthat，knitr，rmarkdown，BiocStyle，SingleCellExperiment，SummarizedExperiment，scRNAseq，cowplot
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	scFeatureFilter_1.16.0.tar.gz
Windows二进制	scFeatureFilter_1.16.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	scFeatureFilter_1.16.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/scFeatureFilter
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ scFeatureFilter
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/scFeatureFilter/
包下载报告	下载数据