SCPCA.

DOI:10.18129 / b9.bioc.scpca.

稀疏对比主成分分析

Biocometiond版本:释放(3.12)

高维生物数据的稀疏对比度主成分分析(SCPCA)的工具箱。SCPCA将稀疏PCA的稳定性和解释性与对比PCA通过使用控制数据与不希望的变化的消除生物信号的能力相结合。还实现并扩展了CPCA。

作者:Philippe Bootau [Aut,Cre,Cph],Nima Hejazi [Aut],曼德里·杜鹃[CTB,THS]

维护者:Philippe Boineau

引文(从R内,输入引文(“SCPCA”)):

安装

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if(!percennamespace(“biocmanager”,squilly = true))install.packages(“biocmanager”)biocmanager ::安装(“scpca”)

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Biocviews. 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯
版本 1.4.0
在生物导体中以来 BIOC 3.10(R-3.6)(1.5年)
执照 mit +文件执照
依靠 r(> = 3.6)
进口 统计,方法,assertthat.娇媚dplyr.邮风stringr.rdpack.MatrixStats.生物相投Elasticnet.Sparsepca.Kernlab.折纸rspectra.合作社矩阵delayedarray
链接到
建议 delayedmatrixstatssparsematrixstats.testthat.(> = 2.1.0),Covr.knRAMAMAMDOW.生物焦ggplot2.ggpubr.泼溅SinglecellexPeriment.Microbenchmark.
系统要求
加强
URL. https://github.com/philboileau/scpca.
Bugreports. https://github.com/philboileau/scpca/issues.
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源包 scpca_1.4.0.tar.gz.
Windows二进制文件 scpca_1.4.0.zip.
Macos 10.13(高塞拉) scpca_1.4.0.tgz.
源存储库 git clone https://git.biocumon.org/packages/scpca.
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.biocondion.org:包/ scpca
包短网址 https://biocumon.org/packages/scpca/
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