Biocometiond版本:释放(3.12)
高维生物数据的稀疏对比度主成分分析(SCPCA)的工具箱。SCPCA将稀疏PCA的稳定性和解释性与对比PCA通过使用控制数据与不希望的变化的消除生物信号的能力相结合。还实现并扩展了CPCA。
作者:Philippe Bootau [Aut,Cre,Cph],Nima Hejazi [Aut],曼德里·杜鹃[CTB,THS]
维护者:Philippe Boineau
引文(从R内,输入引文(“SCPCA”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“4.0”)并输入:
if(!percennamespace(“biocmanager”,squilly = true))install.packages(“biocmanager”)biocmanager ::安装(“scpca”)
对于旧版本,请参阅相应的生物导体释放。
要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:
BROWSEVIGNETTES(“SCPCA”)
HTML. | r script. | 稀疏对比主成分分析 |
PDF. | 参考手册 | |
文本 | 消息 | |
文本 | 执照 |
Biocviews. | 2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 |
版本 | 1.4.0 |
在生物导体中以来 | BIOC 3.10(R-3.6)(1.5年) |
执照 | mit +文件执照 |
依靠 | r(> = 3.6) |
进口 | 统计,方法,assertthat.那娇媚那dplyr.那邮风那stringr.那rdpack.那MatrixStats.那生物相投那Elasticnet.那Sparsepca.那簇那Kernlab.那折纸那rspectra.那合作社那矩阵那delayedarray |
链接到 | |
建议 | delayedmatrixstats那sparsematrixstats.那testthat.(> = 2.1.0),Covr.那kn那RAMAMAMDOW.那生物焦那ggplot2.那ggpubr.那泼溅那SinglecellexPeriment.那Microbenchmark. |
系统要求 | |
加强 | |
URL. | https://github.com/philboileau/scpca. |
Bugreports. | https://github.com/philboileau/scpca/issues. |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接给我 | |
建立报告 |
跟随安装在r会话中使用此包的说明。
源包 | scpca_1.4.0.tar.gz. |
Windows二进制文件 | scpca_1.4.0.zip. |
Macos 10.13(高塞拉) | scpca_1.4.0.tgz. |
源存储库 | git clone https://git.biocumon.org/packages/scpca. |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.biocondion.org:包/ scpca |
包短网址 | https://biocumon.org/packages/scpca/ |
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