屏幕

doi：10.18129/b9.bioc.screpertoire

单细胞免疫受体分析的工具包

生物导体版本：版本（3.15）

构建了Screpertoire，以处理来自T-Cell受体（TCR）和免疫球蛋白（IG）富集工作流的10倍基因组免疫分析的数据，并随后与流行的Seurat和Singlecellexlexlexperiment Perperperriment R套件相互作用。它还允许在不使用表达信息的情况下对单细胞克隆型信息进行一般分析。该软件包充当Startrac和PowerTCR R软件包的包装器。

作者：Nick Borcherding [AUT，CRE]

维护者：nick borcherding

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ scretpertoire”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“ scretpertoire”）

html	R脚本	使用屏幕
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯
版本	1.6.0
在生物导体中	Bioc 3.12（R-4.0）（1。5年）
执照	Apache许可证2.0
要看	GGPLOT2，R（> = 4.0）
进口	字符串，，，，dplyr，，，，RESHAPE2，，，，ggalluvial，，，，Stringr，，，，素食主义者，，，，powertcr，，，，总结性特征，，，，plyr， 平行，多帕尔，方法，utils，rlang，，，，Igraph，，，，seuratObject
链接
建议	尼特，，，，rmarkDown，，，，生物使用，，，，评分，，，，循环，，，，秤，，，，Seurat
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	scretpertoire_1.6.0.tar.gz
Windows二进制	scretpertoire_1.6.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	scretpertoire_1.6.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/screpertoire
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：包装/屏幕
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/screpertoire/
软件包下载报告	下载统计