scTHI

DOI:10.18129 / B9.bioc.scTHI

从单细胞RNA测序数据中识别显著激活的细胞簇配体-受体相互作用

Bioconductor版本:发行版(3.13)

scTHI是一个R包,用于从单细胞中识别活性配体受体对,以便研究肿瘤-宿主相互作用等。scTHI包含一组从肿瘤微环境中对细胞进行分类的特征。

作者:Francesca Pia Caruso [aut], Michele Ceccarelli [aut, cre]

维护者:Michele Ceccarelli

引用(从R中,输入引用(“scTHI”)):

安装

要安装此包,启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:

browseVignettes(“scTHI”)

超文本标记语言 R脚本 使用scTHI
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文本 新闻

细节

biocViews 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯
版本 1.4.0
Bioconductor自 BioC 3.11 (R-4.0)(1年)
许可证 GPL-2
取决于 R (> = 4.0)
进口 BiocParallelRtsne, grDevices,图形,统计
链接
建议 scTHI.dataknitrrmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports https://github.com/miccec/scTHI/issues
取决于我
进口我
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构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包 scTHI_1.4.0.tar.gz
Windows二进制 scTHI_1.4.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) scTHI_1.4.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/scTHI
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ scTHI
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/scTHI/
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