SCTERSOR.

DOI：10.18129 / b9.bioc.sctensor

用张量分解检测单细胞RNA-SEQ数据集的细胞 - 细胞相互作用

Bioconductor版本：释放（3.13）

该算法基于NNTensor的非负塔谱分解（NTD2）。

作者：Koki Tsuyuzaki [Aut，Cre]，Kozo Nishida [Aut]

维护者：Koki Tsuyuzaki

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.1”）并输入：

if（！quancenamespace（“biocmanager”，静静= true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“sctensor”）

对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。

文件

要查看系统中安装此包版本的文档，请启动r并输入：

BROWSEVIGNETTES（“SCTENSOR”）

HTML.	r script.	SCTERSOR.
HTML.	r script.	SCTENSOR：1。数据格式和ID转换
HTML.	r script.	SCTENSOR：2.解释HTML报告
HTML.	r script.	SCTENSOR：3。模拟CCI
HTML.	r script.	SCTENSOR：4。重新分析SCTERSOR的结果
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文本		消息

细节

Biocviews.	2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯
版本	2.2.0
在生物导体中以来	BIOC 3.9（R-3.6）（2年）
执照	艺术-2.0
依靠	r（> = 3.5.0）
进口	方法，rsqlite.那iGraph.那S4Vectors.那情节那反弹.DB.那annotationdbi.那概括分析那SinglecellexPeriment.那nntensor那Retensor.那ab那Plotrix.那热克服那标签云那RAMAMAMDOW.那生物焦那kn那annotationhub.那meshdbi.，grdevices，图形，统计数据，utils，异常值那类别那Meshr.那古司裤那反弹那剂量那蜡笔那会计师那Biocmanager.那visnetwork.那Schex.那ggplot2.
链接到
建议	testthat.那lrbase.hsa.eg.db.那lrbase.mmu.eg.db.那lrbasedbi.那Seurat.那SCTGIF.那homo.sapiens.
系统要求
加强
URL.
取决于我
进口我
建议我
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包档案包

跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。

源包	sctensor_2.2.0.tar.gz.
Windows二进制文件	sctensor_2.2.0.zip.
Macos 10.13（高塞拉）	sctensor_2.2.0.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/sctector.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondudard.org：包/ sctensor
包短网址	https://biocumon.org/packages/sctensor/
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