SCDS

doi:10.18129/b9.bioc.scds

单细胞RNA测序数据的双重拨圈的核内注释

生物导体版本:版本(3.13)

在单细胞RNA测序(SCRNA-SEQ)中,细胞的数据组合有时被认为是单个细胞(Doublets)。SCDS软件包提供了在SCRNA-SEQ数据中计算中注释双重组的方法。

作者:Dennis Kostka [AUT,CRE],Bais Abha [AUT]

维护者:dennis kostka

引用(从r内,输入引用(“ SCD”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.1”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ scds”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ SCD”)

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细节

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版本 1.8.0
在生物导体中 Bioc 3.9(R-3.6)(2年)
执照 麻省理工学院 +文件执照
要看 R(> = 3.6.0)
进口 矩阵,,,,S4VECTORS,,,,Singlecellexperiment,,,,总结性特征,,,,xgboost,方法,统计,dplyr,,,,Proc
链接
建议 生物使用,,,,尼特,,,,RSVD,,,,RTSNE,,,,评分,,,,牛仔图
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我 Singlecelltk
建议我 实验值,,,,muscdata
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 scds_1.8.0.tar.gz
Windows二进制 scds_1.8.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) scds_1.8.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/scds
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/scds
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/scds/
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