scmap

doi：10.18129/b9.bioc.scmap

无监督投影单细胞RNA-seq数据的工具

生物导体版本：版本（3.15）

单细胞RNA-SEQ（SCRNA-SEQ）广泛用于研究复杂组织的组成，因为该技术允许研究人员使用转录组的无监督聚类来定义细胞类型。但是，由于实验方法和计算分析的差异，直接比较两个不同实验中鉴定的细胞通常是具有挑战性的。SCMAP是一种将细胞从SCRNA-SEQ实验投射到不同实验中鉴定出的细胞类型或单个细胞的方法。

作者：Vladimir Kiselev

维护者：vladimir kiselev

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ scmap”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“ scmap”）

html	R脚本	`scmap`软件包小插图
PDF		参考手册
文本		消息
文本		执照

细节

生物浏览	2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯
版本	1.18.0
在生物导体中	Bioc 3.6（R-3.4）（4。5年）
执照	GPL-3
要看	R（> = 3.4）
进口	生物酶，，，，Singlecellexperiment，，，，总结性特征，，，，生物基因，，，，S4VECTORS，，，，dplyr，，，，RESHAPE2，，，，矩阵，，，，代理人，utils，Googlevis，，，，GGPLOT2，方法，统计，E1071，，，，Randomforest，，，，RCPP（> = 0.12.12）
链接	RCPP，，，，rcpparmadillo
建议	尼特，，，，rmarkDown
系统要求
增强
URL	https://github.com/hemberg-lab/scmap
BugReports	https://support.bioconductor.org/t/scmap/
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	scmap_1.18.0.tar.gz
Windows二进制	scmap_1.18.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	scmap_1.18.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/scmap
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/scmap
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/scmap/
软件包下载报告	下载统计