抚慰

DOI:10.18129 / b9.bioc.scmeth.

用于在甲基化数据中进行质量控制分析的功能

Bioconductor版本:释放(3.13)

可以在此处找到分析甲基化数据的功能。有些功能与单细胞甲基化数据相关,但大多数其他功能可用于任何甲基化数据。此工作流程的亮点是全面的质量控制报告。

作者:在G.Harvard.edu的Divy Kangeyan

维护者:在G.Harvard.edu的Divy Kangeyan

引文(从R内,输入引文(“SCMETH”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.1”)并输入:

if(!qualocmamespace(“biocmanager”,静静= true))install.packages(“biocmanager”)biocmanager ::安装(“scmeth”)

对于旧版本,请参阅相应的生物导体释放

文件

要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:

BROWSEVIGNETTES(“SCMETH”)

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文本 消息

细节

Biocviews. 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯
版本 1.12.0
在生物导体中以来 BIOC 3.7(R-3.5)(3年)
执照 GPL-2
依靠 r(> = 3.5.0)
进口 knRAMAMAMDOW.BSSeq.annotationhub.Genomicranges.重塑2.,统计数据,utils,bsgenome.delayedarray(> = 0.5.15),annotatr.概括分析(> = 1.5.6),Genomeinfodb.生物仪器DT.HDF5Array.(> = 1.7.5)
链接到
建议 bsgenome.mmusculus.ucsc.mm10bsgenome.hsapiens.ncbi.grch38.txdb.hsapiens.ucsc.hg38.knowngene.org.hs.eg.db.BioBase.生物根系ggplot2.ggthemes.
系统要求
加强
URL.
Bugreports. https://github.com/aryeelab/scmeth/issues.
取决于我
进口我
建议我 Biscuiteer.
链接给我
建立报告

包档案包

跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。

源包 scmeth_1.12.0.tar.gz.
Windows二进制文件 scmeth_1.12.0.zip.
Macos 10.13(高塞拉) scmeth_1.12.0.tgz.
源存储库 git clone https://git.biocumon.org/packages/scmeth.
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.biocondudard.org:包装/抚慰
包短网址 https://biocumon.org/packages/scmeth/
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