Bioconductor版本:释放(3.13)
可以在此处找到分析甲基化数据的功能。有些功能与单细胞甲基化数据相关,但大多数其他功能可用于任何甲基化数据。此工作流程的亮点是全面的质量控制报告。
作者:在G.Harvard.edu的Divy Kangeyan
维护者:在G.Harvard.edu的Divy Kangeyan
引文(从R内,输入引文(“SCMETH”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“4.1”)并输入:
if(!qualocmamespace(“biocmanager”,静静= true))install.packages(“biocmanager”)biocmanager ::安装(“scmeth”)
对于旧版本,请参阅相应的生物导体释放。
要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:
BROWSEVIGNETTES(“SCMETH”)
HTML. | r script. | 小插图标题 |
PDF. | 参考手册 | |
文本 | 消息 |
Biocviews. | 2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 |
版本 | 1.12.0 |
在生物导体中以来 | BIOC 3.7(R-3.5)(3年) |
执照 | GPL-2 |
依靠 | r(> = 3.5.0) |
进口 | kn那RAMAMAMDOW.那BSSeq.那annotationhub.那Genomicranges.那重塑2.,统计数据,utils,bsgenome.那delayedarray(> = 0.5.15),annotatr.那概括分析(> = 1.5.6),Genomeinfodb.那生物仪器那DT.那HDF5Array.(> = 1.7.5) |
链接到 | |
建议 | bsgenome.mmusculus.ucsc.mm10那bsgenome.hsapiens.ncbi.grch38.那txdb.hsapiens.ucsc.hg38.knowngene.那org.hs.eg.db.那BioBase.那生物根系那ggplot2.那ggthemes. |
系统要求 | |
加强 | |
URL. | |
Bugreports. | https://github.com/aryeelab/scmeth/issues. |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | Biscuiteer. |
链接给我 | |
建立报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。
源包 | scmeth_1.12.0.tar.gz. |
Windows二进制文件 | scmeth_1.12.0.zip. |
Macos 10.13(高塞拉) | scmeth_1.12.0.tgz. |
源存储库 | git clone https://git.biocumon.org/packages/scmeth. |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.biocondudard.org:包装/抚慰 |
包短网址 | https://biocumon.org/packages/scmeth/ |
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