司康饼

DOI:10.18129 / B9.bioc.scone

单细胞规范化表达数据的概述

Bioconductor版本:版本(3.12)

烤饼是一个R方案比较和排名不同单细胞RNA-seq标准化方案的性能和其他高通量分析。

作者:迈克尔•科尔(aut (cph)大卫Risso (aut、cre cph]

维护人员:大卫Risso < Risso。大卫。gmail.com >

从内部引用(R,回车引用(“烤饼”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“烤饼”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes(“烤饼”)

HTML R脚本 司康饼装饰图案
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯
版本 1.14.0
Bioconductor自 BioC 3.5 (r - 3.4)(3.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R(> = 3.4),方法,SummarizedExperiment
进口 图形、统计、跑龙套,aroma.light,BiocParallel,,集群,作文,diptest,刨边机,fpc,gplotsgrDevices,hexbin,limma,matrixStats,mixtools,RColorBrewer,引导,rhdf5,RUVSeq,rARPACK
链接
建议 BiocStyle,DT,ggplot2,knitr,miniUI,NMF,情节,reshape2,rmarkdown,食物,scRNAseq,闪亮的,testthat,visNetwork,doParallel,BatchJobs
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports https://github.com/YosefLab/scone/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包 scone_1.14.0.tar.gz
Windows二进制 scone_1.14.0.zip
macOS 10.13(高山脉) scone_1.14.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/scone
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/烤饼
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/scone/
包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请阅读发布指南。文章质疑Bioconductor到以下位置: