Scoreinvhap

doi:10.18129/b9.bioc.scoreinvhap

获得预定义区域的反转状态

生物导体版本:版本(3.13)

ScoreInvHap可以获得已知反转的样本倒置状态。ScoreInVHAP使用SNP数据作为输入,并需要有关反转的以下信息:不同单倍型中的基因型频率,区域SNP和反转状态之间的R2和参考中的杂合子基因型。该软件包包括21个倒置的此数据。

作者:Carlos Ruiz [Aut],DolorsPelegrí[aut],Juan R. Gonzalez [AUT,CRE]

维护者:dolors belegri-siso

引用(从r内,输入引用(“ Scoreinvhap”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.1”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ scoreinvhap”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ ScoreInvhap”)

html R脚本 与ScoreInvHap的反转基因分型
PDF 参考手册
文本 执照

细节

生物浏览 2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯
版本 1.14.0
在生物导体中 Bioc 3.6(R-3.4)(3.5岁)
执照 文件执照
要看 R(> = 3.6.0)
进口 生物弦, 方法,snpstats,,,,变体,,,,基因组机,,,,生物比较,图形,总结性特征
链接
建议 测试,,,,尼特,,,,生物使用,,,,rmarkDown
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 scoreinvhap_1.14.0.tar.gz
Windows二进制 scoreinvhap_1.14.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) ScoreInvhap_1.14.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/scoreinvhap
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/scoreinvhap
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/scoreinvhap/
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